Die Zahlstelle hat die Aufgaben, die Fördergelder der Kommission anzufordern, entgegenzunehmen und die Auszahlungen nach entsprechenden Prüfungen an die Projektträger zu leisten.
Mit der Aufgabe der Zahlstelle ist die Investitions-und Strukturbank Rheinland-Pfalz (ISB) betraut.
Des Weiteren nimmt die ISB die Aufgaben der Monitoringstelle für die computergestützte Datenverwaltung des Programms wahr.