Das Gemeinsame Technische Sekretariat bereitet die Beschlüsse des Lenkungsausschusses und des Begleitausschusses vor.
Auch die erste Prüfung der Anträge auf Vollständigkeit, innere Konsistenz, Aussagekraft und formale Förderfähigkeit wird dort durchgeführt.
Im GTS sind alle Programmpartner vertreten. Das GTS und die Unterstützenden Fachbehörden stehen ständig im gegenseitigen Austausch.